... При экспорте в СП4 не экспортируются настройки приборов и шаблон заполнения отчета, это так реализован экспорт?
Да, так и должно быть. Проблема опять же в СП3, в его БД хранится крайне мало действительно считанных приборных настроек, а тех что есть не достаточно для СП4. В связи с вышеизложенным, мы решили не переносить их.
Под "шаблон заполнения отчета" Вы наверное имеете в ввиду "Данные для шапки" на вкладке "Отчетные формы" в окне "Свойства узла" программы Отчеты? Эти данные также не переносятся, т.к. у СП4 для них заложен другой формат, к примеру адрес, он в СП3 просто строка, а в СП4 это справочник в виде дерева.